Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ddb2Q99J79 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddb2Q99J79 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ddb2Q99J79 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ddb2Q99J79 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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