Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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