Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bbox1Q924Y0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms