Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Csmd1Q923L3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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