Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf3Q922U1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms