Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csde1Q91W50 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms