Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tdrd3Q91W18 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd3Q91W18 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms