Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col26a1Q91VF6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col26a1Q91VF6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms