Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cabp4Q8VHC5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cabp4Q8VHC5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms