Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rprd1aQ8VDS4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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