Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uhrf1Q8VDF2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms