Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms