Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3G9

Tspan8, Tetraspanin-8, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan8Q8R3G9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan8Q8R3G9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms