Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf183Q8QZS5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms