Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud6bQ8K2H2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud6bQ8K2H2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms