Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd3Q8K2F0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd3Q8K2F0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms