Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scara5Q8K299 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms