Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbsnQ8CIT9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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