Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clip4Q8CI96 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clip4Q8CI96 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms