Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms