Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Csnka2ipQ8CH19 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Csnka2ipQ8CH19 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Csnka2ipQ8CH19 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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