Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Setd1bQ8CFT2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms