Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms