Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms