Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prpf31Q8CCF0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms