Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf2Q8CB19 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms