Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4aQ8C9S8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4aQ8C9S8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4aQ8C9S8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4aQ8C9S8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4aQ8C9S8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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Atg4aQ8C9S8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4aQ8C9S8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4aQ8C9S8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms