Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp20Q8C6M1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp20Q8C6M1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms