Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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FarsaQ8C0C7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FarsaQ8C0C7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FarsaQ8C0C7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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