Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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