Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Iffo1Q8BXL9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms