Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trerf1Q8BXJ2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trerf1Q8BXJ2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms