Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ube3dQ8BX13 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ube3dQ8BX13 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ube3dQ8BX13 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ube3dQ8BX13 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube3dQ8BX13 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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