Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbbp5Q8BX09 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbbp5Q8BX09 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbbp5Q8BX09 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbbp5Q8BX09 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbbp5Q8BX09 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbbp5Q8BX09 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbbp5Q8BX09 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rbbp5Q8BX09 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rbbp5Q8BX09 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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