Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pum3Q8BKS9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms