Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp1Q8BJQ2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp1Q8BJQ2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp1Q8BJQ2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp1Q8BJQ2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp1Q8BJQ2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp1Q8BJQ2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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