Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubash3bQ8BGG7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubash3bQ8BGG7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms