Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Susd6Q8BGE4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Susd6Q8BGE4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Susd6Q8BGE4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Susd6Q8BGE4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Susd6Q8BGE4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Susd6Q8BGE4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms