Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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