Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfascQ810U3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms