Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cfap100Q80VN0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cfap100Q80VN0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms