Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp8Q80U87 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp8Q80U87 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp8Q80U87 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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