Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SnphQ80U23 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms