Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NischQ80TM9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
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