Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sgo2Q7TSY8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sgo2Q7TSY8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms