Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kcnf1Q7TSH7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kcnf1Q7TSH7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms