Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp397Q7TNK4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp397Q7TNK4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms