Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdcl2Q78Y63 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl2Q78Y63 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms