Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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