Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cnih3Q6ZWS4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms